Dieses Lehrbuch bildet eine Brücke von der Biologie zur Bioinformatik. Die Methoden für die Erstellung klassischer Stammbäume werden zunächst resümiert, bevor DNA- und Protein-Sequenzen als digitalisierbare Merkmale den Übergang zu den Prinzipien der Bioinformatik ermöglichen. Der Vergleich von Sequenzen in bildet die Grundlage für molekulare Homologien, ermöglicht die Sequenzsuche in Datenbanken und erlaubt die Ableitung von molekularen Phylogenien. Die wesentlichen Prinzipien für moderne Anwendungen der Bioinformatik, wie Methoden von und die Vorhersage von Protein-Strukturen, finden sich im letzten Kapitel. Aufgaben und ihre Lösungen ermuntern zur Anwendung der BIOinformatik und motivieren zu eigenen Fragestellungen.
Aktualisiert: 2023-03-14
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Dieses Lehrbuch bildet eine Brücke von der Biologie zur Bioinformatik. Die Methoden für die Erstellung klassischer Stammbäume werden zunächst resümiert, bevor DNA- und Protein-Sequenzen als digitalisierbare Merkmale den Übergang zu den Prinzipien der Bioinformatik ermöglichen. Der Vergleich von Sequenzen in bildet die Grundlage für molekulare Homologien, ermöglicht die Sequenzsuche in Datenbanken und erlaubt die Ableitung von molekularen Phylogenien. Die wesentlichen Prinzipien für moderne Anwendungen der Bioinformatik, wie Methoden von und die Vorhersage von Protein-Strukturen, finden sich im letzten Kapitel. Aufgaben und ihre Lösungen ermuntern zur Anwendung der BIOinformatik und motivieren zu eigenen Fragestellungen.
Aktualisiert: 2023-04-04
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Dieses Buch ist ein praktischer Ratgeber für Biologinnen und Biologen, die Multiple Sequenzalignments (MSAs) für ihre Datenanalysen verwenden und einen verständlichen Überblick über die vielen verschiedenen Programme suchen. Trotz ihres wichtigen Stellenwertes in der Datenanalyse herrscht Unsicherheit unter den Forschenden wie MSA-Programme genau funktionieren - ganz zu schweigen davon, wie und warum die unterschiedlichen Analysen zu verschiedenen Ergebnissen führen. Welches Programm ist für die Auswertung meiner Daten das richtige und wie kann ich sicherstellen, alle relevanten Erkenntnisse aus den Alignments gezogen zu haben? Dieses Buch bietet hilfreiche Erklärungen und Hintergründe ohne große bioinformatische Vorkenntnisse vorauszusetzen und führt die Leserinnen und Leser langsam in die Thematik ein.Im ersten Teil des Buches werden die möglichen Einsatzfelder wie auch die Formate, die üblicherweise von MSA-Programmen produziert werden, im Detail beschrieben. Ebenso werden auf unkomplizierte Weise die zentralen Algorithmen sowie die inneren Abläufe der gängigsten MSA-Programme der Vergangenheit und der Gegenwart in größerer Detailtiefe erklärt. Den zweiten Teil des Buches bildet ein ausführlicher datenbasierter Vergleich zwischen MSA-Programmen, der als Entscheidungshilfe für die Programmauswahl für dein nächstes Alignment dienen soll.
Aktualisiert: 2023-04-04
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Dieses Buch ist ein praktischer Ratgeber für Biologinnen und Biologen, die Multiple Sequenzalignments (MSAs) für ihre Datenanalysen verwenden und einen verständlichen Überblick über die vielen verschiedenen Programme suchen. Trotz ihres wichtigen Stellenwertes in der Datenanalyse herrscht Unsicherheit unter den Forschenden wie MSA-Programme genau funktionieren - ganz zu schweigen davon, wie und warum die unterschiedlichen Analysen zu verschiedenen Ergebnissen führen. Welches Programm ist für die Auswertung meiner Daten das richtige und wie kann ich sicherstellen, alle relevanten Erkenntnisse aus den Alignments gezogen zu haben? Dieses Buch bietet hilfreiche Erklärungen und Hintergründe ohne große bioinformatische Vorkenntnisse vorauszusetzen und führt die Leserinnen und Leser langsam in die Thematik ein.Im ersten Teil des Buches werden die möglichen Einsatzfelder wie auch die Formate, die üblicherweise von MSA-Programmen produziert werden, im Detail beschrieben. Ebenso werden auf unkomplizierte Weise die zentralen Algorithmen sowie die inneren Abläufe der gängigsten MSA-Programme der Vergangenheit und der Gegenwart in größerer Detailtiefe erklärt. Den zweiten Teil des Buches bildet ein ausführlicher datenbasierter Vergleich zwischen MSA-Programmen, der als Entscheidungshilfe für die Programmauswahl für dein nächstes Alignment dienen soll.
Aktualisiert: 2023-03-14
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